Biologie cellulaire et moléculaire
Domaine : Chimie - Biologie

• Connaître les techniques avancées en biologie utilisées dans le domaine analytique.
• Connaître les principes de la cytométrie en flux et les réactifs fluorescents les plus appropriés. Par la connaissance théorique du fonctionnement des différents appareillages, pouvoir les metttre en oeuvre dans des applications potentielles.
• Savoir s’orienter dans la jungle des mots et des concepts propres à l’immunologie (interactions mises en jeu dans le système immunitaire) afin d’avoir une vision globale des techniques de production industrielle et d’analyse en biothérapie.
• Pouvoir mieux choisir les méthodes immunologiques les plus appropriées dans le cadre de projet.
• Avoir une connaissance des concepts fondamentaux de la génétique fondamentale
• Aborder les stratégies de remplacement génétiques et leurs utilisations

• Connaître les nouvelles stratégies de séquençage et d’étude fonctionnelle des génomes, choisir la méthode en fonction des objectifs.
• Comprendre les langages et concepts utilisés en génomique et dans les banques de données biologiques disponibles sur le WEB (inférence, homologie, similarité, ontologie…),
• Utiliser des méthodes d’alignement de séquences et en interpréter les résultats,
• Faire le lien entre séquence, structure et fonction, en utilisant des outils adaptés.

• Comprendre les différentes stratégies possibles.
• Connaître l’importance de la sélection de la séquence cible.
• Connaître l’importance de la transfection.
• Comprendre le choix et l’utilisation des contrôles expérimentaux.

• Comprendre comment la cellule produit les acides nucléiques (ADN et ARN) et fabrique les protéines.
• Maitriser le vocabulaire de la biologie moléculaire.
• Définir les différents niveaux d’organisation présents dans les structures des protéines et des acides nucléiques.
• Appréhender d’un point de vue théorique les techniques classiques de biologie moléculaire telles que la manipulation, la modification et le séquençage de l’ADN.
• Choisir au mieux les outils de biologie moléculaire et analyser les résultats expérimentaux.

• Adapter et comprendre l’importance de la préparation des échantillons cellulaires (2D/3D) en vue des analyses par cytométrie.
• Comprendre et appliquer les principes de la cytométrie en flux.
• Mettre en place des études de criblage à haut débit par cytométrie capillaire.

• Maîtriser les principes théoriques de la cytométrie en flux.
• Se familiariser avec les appareils, leurs modes de fonctionnement.
• Utiliser les différentes applications de la cytométrie en flux.
• Connaître les méthodes et les bonnes pratiques d’analyse des résultats.

• Placer les cellules dans des conditions physiologiques pendant l’observation.
• Comprendre les principes de base en microscopie en lumière transmise et à fluorescence.
• Sélectionner une sonde fluorescente adaptée à sa question.
• Définir et régler de manière optimale les conditions d’acquisition en fonction des phénomènes à observer.
• Réaliser un film en 2 ou 3 dimensions.
• Améliorer la netteté d’un film 3D en utilisant la déconvolution.
• Réaliser des analyses simples (intensité de signal, vitesse de déplacement, tracking automatique d’objets).

Au sein des organismes pluricellulaires, les cellules adhérent de manière permanente ou transitoire un substrat appelé «matrice extracellulaire». L’adhérence cellulaire est directement impliquée dans le maintien de la cohésion tissulaire et dans la régulation de la migration. Adhérence et migration sont essentielles à la cicatrisation, la réponse immunitaire et l’angiogénèse et leur dérégulation est impliquée dans de nombreuses pathologies comme le cancer et la formation des métastases.

• Maitriser les bases de la culture cellulaire.
• Développer des cultures cellulaires.
• Gérer ces cultures dans son laboratoire.